Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms