Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms