Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3LQ8TDB6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms