Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BEST4Q8NFU0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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