Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms