Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms