Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms