Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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