Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APLFQ8IW19 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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