Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms