Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms