Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC141Q6ZP82 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms