Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms