Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms