Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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