Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM164Q5U3C3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms