Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RPL39P5Q59GN2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL39P5Q59GN2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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