Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms