Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms