Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA3Q53S33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms