Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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