Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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GEN1Q17RS7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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