Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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