Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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