Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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