Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SGCAQ16586 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SGCAQ16586 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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