Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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