Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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