Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms