Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms