Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABEP1Q15276 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABEP1Q15276 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABEP1Q15276 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABEP1Q15276 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABEP1Q15276 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABEP1Q15276 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABEP1Q15276 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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