Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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