Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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