Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SSPNQ14714 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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