Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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