Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms