Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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