Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms