Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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