Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms