Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAMK2BQ13554 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms