Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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