Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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BNIP3Q12983 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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