Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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