Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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