Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EP300Q09472 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EP300Q09472 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EP300Q09472 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EP300Q09472 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EP300Q09472 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms