Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms