Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms