Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms