Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms